Breath of Fire II

A história é tomada em um mundo fictício sem um nome em particular, habitado por, além de seres humanos, criaturas de raças antropomórficas que convivem entre si. Neste mundo, a maioria de pessoas praticam uma religião nova parecida ao catolicismo chamada Evanismo, esquecendo à crença prévia no Deus Dragão.

O personagem principal é um rapaz de 16 anos chamado Ryu, que tem o mesmo nome dos outros protagonistas da série. Ele se vê sozinho no mundo após o desaparecimento de seu pai e sua irmã e todos os moradores de seu vilarejo se esquecem de quem ele é. Como membro do Dragon Clan, Ryu é capaz de se transformar em dragões com poderes devastadores, e passa a viver como "Ranger", espécie de mercenário. Ele segue com seu amigo e companheiro de profissão, Bow, um ladrão membro de uma raça de cães humanóides que usa uma besta em batalha.

Conforme o jogo se desenrola, outros personagens se agregam ao grupo, como Katt, uma integrante da raça de felinos humanóides Woren, que é gladiadora em um coliseu; Rand, um tatu humanóide que luta com as mãos nuas; Nina, descendente da Nina original de Breath of Fire e princesa de um clã de humanos alados, exilada por ter asas negras; Sten, um antigo soldado de um reino de macacos que vive como mágico; Jean, um príncipe de uma raça de sapos que luta para recuperar seu trono; e Spar, um homem-planta sem emoções que pode se comunicar com a natureza. A feiticeira imortal Bleu do jogo anterior é uma personagem opcional e também pode ser recrutada.